Analisi di frammenti PCR:

Qualsiasi amplificato che abbia una lunghezza compresa tra 50bp e 450bp puo' essere analizzato con il sequenziatore.
I vantaggi sono:

• maggiore risoluzione e sensibilita' rispetto al gel di agarosio
• possibilita' di avere la misura precisa della lunghezza del frammento in riferimento ad uno standard di peso molecolare interno che viene corso insieme ai campioni.
• possibilita' di avere una misura quantitativa relativa in base all'ampiezza del picco e all'intensita' del segnale.
• possibilita' di analizzare molti campioni contemporanemente.

Come preparare i campioni da inviare:

• 15 ng per ogni marcatore (indicare sul form, nelle informazioni aggiuntive, le misure attese, base pair, per ciascuno.
• spedire a 4°C oppure liofilizzati (max 50 °C) a temperatura ambiente
• si consiglia di verificare gli amplificati e le quantificazioni su gel di agarosio prima di spedire i campioni

Gli amplificati di PCR derivanti da protocolli e tecniche di natura diversa (Microsatelliti, AFLP, OLA, SNPLex, SNAPShot ecc.) devono essere ottenuti utilizzando uno dei seguenti marcatori: -6-FAM, VIC, NED e PET.
I campioni possono anche comprendere piu' marcatori contemporaneamente
I risultati entro 24/48 ore vengono riassunti in un foglio excel con la misura dei frammenti, l'area dei picchi ed i data point, piu' le immagini dei plot corrispondenti.

Genotipizzazione di animali di laboratorio:

Il servizio permette l'identificazione e la caratterizzazione di topi transgenici e prevede:

• l'estrazione di DNA genomico a partire da biopsie caudali di topo.
• la sintesi degli oligo per amplificare il gene/i.
• PCR.
• Gel di agarosio.
  
• diagnosi.

Come preparare i campioni da inviare:

Frammenti di code da 0.5 a 1.2 cm (circa 20 mg):

• in Etanolo, utilizzare singoli tubi da 1.5 ml identificati con numero progressivo
• in ghiaccio secco, utilizzare singoli tubi da 1.5 ml identificati con numero progressivo o deep-well da 96 pozzetti con relativo schema di identificazione

I risultati con le diagnosi saranno riassunti in un foglio excel e accompagnati dalla relativa foto del gel. Tutto quello che dovrai fare è inviarci le biopsie caudali, e il protocollo di PCR al resto pensiamo noi.
Se hai bisogno di ottimizzare il protocollo di PCR per l'individuazione dei transgeni contatta il laboratorio (laboratori@biofabresearch.it ) A richiesta puo' essere utilizzato il sequenziatore per analizzare i profili di amplificazione.
Gli oligo che verranno sintetizzati, (costo a parte pulsante del quaderno) verranno conservati in una vostra banca oligo personale. (durata due anni) con creazione di una folder interattiva nell'area riservata del nostro sito. Potrai consultare la banca e riutilizzare gli oligo ogni volta che vorrai.

Come preparare i campioni da inviare

• frammenti di code da 0,5 a 1,2 cm , circa 20 mg in Etanolo
• utilizzare singoli tubi da 1,5 ml identificati con numero progressivo.
• in ghiaccio secco :

utilizzare singoli tubi da 1,5 ml identificati con numero progressivo o deep well da 96 pozzetti con relativo schema di identificazione.

Analisi di linkage:

• Wide genome scan 2CM tramite il sistema dell'Abi SNPLex Genotyping system
• Analisi di SNPs cromosoma / locus specifici (info@biofabresearch.it)