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Oligo per sequenziare e universali

Oligo per Sequenziare

Ecco un elenco di regole per disegnare un buon oligo:

Lunghezza di circa 18-25 basi
T di annealing maggiori o uguali a 50°C
Percentuale di C e G tra il 40-70%
3' stabile (G o C).
Evitate ripetizioni, stretch, palindroni e hairpin

Nel caso di OLIGO DEGENERATI consigliamo di aumentare la quantita' di picomoli in base al numero delle degenerazioni presenti.

Oligo Universali

Vengono forniti gratuiti, pero’ e’ MOLTO IMPORTANTE che verificate che la sequenza sia corrispondente
esattamente a quella del vostro plasmide.

I
II
III
IV
V
VI
VII
VIII
IX
X
XI
XII
XIII

M13
M13 rev
T3
T7
SP6
SP6PpcDNA3
KS
SK
PCR3.1
BGH REVERSE
T7term NOVAGEN
5' pGEX
3' pGEX

5' TGT AAA ACG ACG GCC AGT 3'
5' CAG GAA ACA GCT ATG ACC 3'
5' ATT AAC CCT CAC TAA AGG GA 3'
5' TAA TAC GAC TCA CTA TAG GG 3'
5' AGG TGA CAC TAT AGA ATA CTC 3'
5' AGG TGA CAC TAT AGA ATA GGG 3'
5' TCG AGG TCG ACG GTA TC 3'
5' CGC TCT AGA ACT AGT GGA TC 3'
5' TAG AAG GCA CAG TCG AGG 3'
5' TAG AAG GCA CAG TCG AGG 3'
5' CTAGTTATTGCTCAGCGG 3'
5' GGGCTGGCAAGCCACGTTTGGTG 3'
5' GCATGTGTCAGAGGTTTTCACCG 3'

Altri Oligo

Se vi dovessero essere utili anche questi sono gratuiti.

I
II
III
IV
V

EGFP-C
POLI T N
POLI T M
POLI T R
POLI T S

5' ATG GTC CTG CTG GAG TTC GTG 3'
5' TTT TTT TTT TTT TTT TTT TTT N(A/C/T/G) 3'
5' TTT TTT TTT TTT TTT TTM(A/C) 3'
5' TTT TTT TTT TTT TTT TTR(A/G) 3'
5' TTT TTT TTT TTT TTT TTS(G/C) 3'